后来祁轩轩觉得光独孤庆天受罪还不解恨，也不能让姐姐独孤琴好过，于是便安排独孤无寿前往傲来山，告诉独孤琴自己的妹妹就是江南祁府的大小姐祁轩轩，并且以祁轩轩的性命要挟独孤琴顶替自己和一笑山庄少庄主秦小痴成亲，借口是偷到一笑剑法。其实就是让姐姐独孤琴嫁给一个陌生的男人，以此来折磨独孤琴，借以消消自己这么多年失去父爱的怨气。
虽然祁初夫妇对自己很好，但那毕竟不能代表父爱。
早在青紫峰剑圣之战之前，镇北王爷朱万钧便因与独孤庆天不睦，于是私下与独孤无寿沟通，祁轩轩知道此事之后，让独孤无寿继续配合镇北王爷，因为如果自己想要称霸武林，有镇北王爷做后台，自然腰杆子会硬许多。
镇北王爷虽有野心，但是想到淮南王之事，心里就是没有底气，所以就想利用独孤圣教将一笑山庄、江南祁府、齐云楼、铁鹰堂、封仙阁等各门高手尽早除掉，因为这些江湖势力在淮南王平叛一事中，都是站在太子和尉迟小令那边，如果自己日后起事，这些人和帮派则事先必须要除掉，以免后顾之忧。
镇北王承诺独孤圣教一统江湖，而独孤圣教承诺消灭那些阻挡镇北王起事的江湖势力。一个在朝堂，一个在江湖，互相帮扶。
所以独孤圣教便利用一笑山庄二庄主秦小颠大喜之日动手，起初是想让独孤琴配合，后来发现独孤琴已经深深爱上了秦小痴，不忍下手，只好让人给独孤琴下了些剂量少许的药物，让独孤琴晕过去一段时间，以免引起别人的警觉。
至于后面的事情发展，因为六扇门尉迟小令的介入，事情并没有按照当初预想的流程走下去，反而变得越来越糟糕起来，以至于让尉迟小令将龙门山独孤无寿等人消灭殆尽。
对于独孤无寿的死，祁轩轩认为这是报应，其实自己也曾多次想将独孤无寿灭掉，因为独孤无寿将父亲独孤庆天害得生不如死，不管怎样，自己再恨独孤庆天，但也改变不了父女这层血缘关系。
就像自己恨姐姐独孤琴一样，但是只能允许自己随便怎么恨都行，但是绝对不允许别人去伤害，只是后来独孤无寿因为害怕自己冒充独孤庆天被独孤琴揭穿，私下瞒着自己追杀独孤琴。当然这件事情还是独孤琴亲口告诉祁轩轩的，要不然祁轩轩还一直蒙在鼓里。
独孤琴听到祁轩轩对自己也没有隐瞒，虽然有些气愤，恨不得使劲打几下，可是独孤琴知道正因为祁轩轩将自己当做亲姐姐，才和自己说了这么多，如果没有将自己当做姐姐，则根本不会告诉一丝的信息。
只是后来独孤无寿将独孤庆天和独孤琴封死在日光岩的山洞之中的时候，祁轩轩似乎有些后悔起来，因为被困在山洞之内的两个人可都是自己在这世上最亲的人。
可是后悔已经晚矣，祁轩轩曾经想过用炸药炸开那扇石门，又怕伤到山洞里面的独孤庆天和独孤琴。所以迟迟未敢动手。
至于山洞里面有鱼有水，这些祁轩轩都是知道的，只不过没有说出来给独孤无寿那些人知道而已。因为这龙门山的地形祁轩轩都已经不知熟悉过多少遍了，这一点非常像自己的父亲独孤庆天。
祁轩轩知道山洞里面的人不会饿死和渴死。