京城叛乱之后，朱祁钰曾下令在全城进行搜捕，追捕叛党，不过最终并没有找到太上皇朱祁镇，以及叛乱魁首徐有贞两人，甚至连徐有贞的亲人都消失得无影无踪了。一时之间，徐有贞以及上皇的去向成为了京城叛乱的最大谜团。显然，当朱祁钰下令在全国范围内搜捕叛党，并且重金悬赏徐有贞人头的情况之下，徐有贞是不可能留在帝国境内的，只有逃出帝国，才有一线生存的希望！
也就是在这一情况之下，徐有贞带着上皇逃到了辽阳，然后伪装成商人进入了朝鲜王国，再在朝鲜南面港口，以重金买通了一伙日本海盗，准备逃往日本。在上了日本海盗的船后，徐有贞遇到了他根本就没有想到的麻烦，那家来岛家控制的海盗并不想将他们送到日本去，而是见财起心，要杀人取财。
危机关头，徐有贞说出了自己的身份，以及朱祁镇的身份，并且要见海盗的统帅。也算是徐有贞命不该绝，这支海盗的头目是一个见了点世面的人，而且也听说了明帝国京城发生的叛乱。他一搞清楚徐有贞与朱祁镇的身份之后，就知道这两人奇货可居，立即就制止了手下，然后带着两人返回了来岛家的老巢！
这时候，来岛家已经与织田信长结盟，加入了西军，并且刚在织田信长与本愿寺的战争中立了大功，助织田信长击败了本愿寺的水军，正受到织田信长的重用呢。很快，徐有贞与朱祁镇就被秘密地转移到了名古屋，并且被织田信长软禁了起来。
也就是在这个时候，徐有贞的命运出现了转机，日本的历史也在这个时候走上了另外一条轨道。第一个见到徐有贞的不是织田信长本人，而是织田信长手下最厉害的两员大将之一的丰臣秀吉！显然，这两人碰到一起就绝不会有什么好事！
丰臣秀吉早就有了入侵朝鲜与大明的野心，在西军控制了日本大半辟江山，将东军压到角落里去。并且顺利地征服了九州与四国之后，丰臣秀吉就多次鼓动织田信长发兵朝鲜。特别是在也先率瓦刺大军进攻明帝国，一路打到了京城的时候，丰臣秀吉更是认为入侵朝鲜，并且以朝鲜为跳板进攻大明的时机已经成熟了，几乎一有机会就会去鼓动织田信长发兵朝鲜。显然，织田信长不是疯子，他非常清楚瘦死的骆驼比马大这个道理，明帝国就算是国运衰落，也要比日本强大很多，而且日本国内的战乱还没有结束，如果发兵朝鲜的话，那不是给东军机会吗？
徐有贞的到来，让丰臣秀吉看到了实现自己野心的希望。在徐有贞这里，丰臣秀吉获得了一些他梦寐以求的情报，比如明帝国有多衰弱，国内的情况有多么的混乱。而丰臣秀吉兴奋之余，甚至没有多加考虑这些话的真假程度。在当时的情况下，徐有贞为了保住自己的性命，让织田信长不把他交还给朱祁钰，他恐怕什么话都能说得出来。而且，这个阴谋家在看出了丰臣秀吉的目的之后，更是竭力鼓动丰臣秀吉去说服织田信长入侵朝鲜，然后打回大明，好实现他控制明帝国的野心！
丰臣秀吉也正是拿着这些废话去找到了织田信长，而织田信长当时也正好苦于没有办法对付上杉谦信，与东军之间的战争进入了僵持阶段。而西军各利益集团是依靠一个共同的敌人才团结起来的，如果对东军久攻不下，那么各利益集团必然会为了自己的最高利益而分道扬镳，甚至有可能投靠东军，结果导致西军全面失败。在无法迅速击败东军的情况之下，织田信长需要为西军找一个新的目标，一个比击败东军更崇高的目标。显然，此时丰臣秀吉的提议影响了织田信长的决定，在发现西军正在崩溃的情况之下，织田信长做出了决定，委派丰臣秀吉率军入侵朝鲜，而他则留在日本，继续对付上杉谦信！
正是这个决定，最终彻底地改变了日本历史的走向，也就有了后来丰臣秀吉侵朝，以及数十万日军在朝鲜被明军完全歼灭，而明帝国也正是为了这一原因而发动了东征战争！当然，这些都已经是往事了，而且在前面的篇幅中已经提到，就不再多啰嗦。
侵朝失败之后，织田信长已经没有了选择。而且丰臣秀吉神秘失踪，下落不明，让织田信长失去了最厉害的将领。如果不是徐有贞确实口舌厉害的话，恐怕在织田信长一怒之下就把他给杀了。不过，这徐有贞一番唇舌之后，织田信长不但没有杀他，反而还重用了徐有贞。关于织田信长为什么会重用徐有贞，这只有朱祁钰与上杉谦信才知道，因为朱祁钰，上杉谦信两人与织田信长单独谈话的那一段历史根本就没有记载下来，谈话内容自然不会出现在任何一本历史书上。不过，可以推断，在当时的情况之下，织田信长确实没有太多的选择，启用徐有贞，也许仅仅是为了更多的了解明帝国的情况，不过，这最终也导致了织田信长的悲惨结局！
后来，东军秘密策划，将天皇接到了宇都宫，而被织田信长送到了天皇身边去的朱祁镇也被东军一起劫持到了宇都宫去，所以后来卫广率第五军突击宇都宫的时候，找到了朱祁镇，却没有找到徐有贞，因为徐有贞一直留在织田信长身边，根本就没有离开过织田信长半步！
明军渡海东枕，织田信长迅速落败，而最终说服织田信长放弃抵抗，与明军谈和的人正是徐有贞。从这一点上来看，徐有贞这人不但玩阴谋手段厉害，而且还很能忍。如果他不能忍的话，也不可能屈居于织田信长之下，利用织田信长的力量来与朱祁钰做对了。
东征之后，织田信长在徐有贞的帮助下，制定了一套阴奉阳违的策略。表面上，西军严格控制自己的行为，并且听从天皇的中央政府调遣，并且让出了很多地盘。而实际上，西军一直在大规模采购武器装备，囤积作战物资，光是粮草，三年多时间之内，织田信长就利用尾张地区的富庶，为反叛准备了至少三年的粮草。当然，这三年多时间之内，织田信长，准确的说应该是徐有贞为了达到叛乱的目的，还做了很过多事情。
比如，通过买通中央政府的官员，在很多前西军控制的地方按插自己的人手，秘密联络以前的同盟者。甚至通过威逼利诱让一些中央政府，乃至东军的将领与官员投靠到了西军的怀抱里来。不说别的，三年多时间之内，中央军从明帝国采购的武器装备之中，至少有三成变相流入了西军手里，而这其中，以火炮为主！
经过了三年的准备，当得知朱祁钰率领的明帝国远征军在西洋遇到了麻烦时，徐有贞与织田信长产生了严重的分歧，这也最终导致了两人之间的一场严重对抗。或者说，正是在这个时候，一心想要复仇的徐有贞彻底地对小心过头织田信长丧失了信心。当时，徐有贞认为明军远征西洋，是反叛的最好时机，而织田信长则坚持认为，三年多的准备时间太短暂了，要想反叛成功，并且将明军赶出日本，还至少需要三年的时间。显然，在这一点上，织田信长的判断是正确的，不过也不能说徐有贞的判断没有一点道理。如果明帝国集中全力西征的话，三年之内，恐怕那些能够拖住明帝国后腿的国家都被打败了，如果那个时候再发动叛乱的话，根本就没有多少机会。就算能够将明帝国驻日军队全都赶走，难道朱祁钰不会再来一次东征，集中更多的，更强大的军队，一举将日本的反叛势力给铲平？