海况如此恶劣，朱由检自然是走不成了，只好等风暴稍小些再登船。可他也实在没想到，这一等居然就是七天！
这时朱由检也不禁有些懊恼，心想这个时代要是有天气预报就好了。如今自己被困在皮岛上，在大凌河的边军却是越来越危险，真是急死人不偿命。如果仅仅是在陆地上相隔千里，朱由检还可以使用信鸽；可皮岛接近黄海东岸，信鸽也不能远涉大海，他完全无法获得辽东前线的任何消息！
可是即使提前知道海上会有暴风，是不是就不要来皮岛了呢？如果那样，袁崇焕一定会杀了毛文龙，东江镇也就此不复存在，同样是一场难以承受的灾难。朱由检不禁苦笑，都知道两害相权择其轻，可当局者迷，孰轻孰重，谁又能分得清楚？
不过闲着也是闲着，既然回不了宁远，朱由检也只得利用这几天时间，将东江镇好好整顿了一番。
首先，自然是清查岛上军民人数。原来毛文龙拦着不让查，朝廷也从来不知道皮岛到底有多少人，需要供给多少粮饷。现在毛文龙已经成了阶下囚，这项工作自然好做了。
经过清点，不算那些已经死掉的乱兵，整个东江镇共有在册边军八千多人。其中驻在皮岛本岛上的有三千多人，在周围大小数十个上还分驻两三千人。其余两千多人，则驻在一海之隔的朝鲜半岛平安北道铁山郡。
这说起来就有点复杂了。毛文龙管辖的地区之所以叫“东江镇”，其实就是指鸭绿江以东，这里已是朝鲜的领土。朝鲜原为大明的属国，毛文龙在此驻军，等于是帮朝鲜人抵御女真人的进攻，因此最起码刚开始时，朝鲜对东江镇的存在还是欢迎的。
但现在朝鲜已经投降后金，尤其是阿敏率领四旗大军侵略朝鲜时，顺带攻破铁山，将此地的汉人军民屠戮殆尽。现在后金军虽然退走了，但铁山城已是城垣破败，难以御敌。毛文龙之所以舍不得这块地方，一方面是他在铁山占据了不少田产，另一方面，没准他还真有入侵朝鲜的想法，因为此时的朝鲜实在就是个软柿子，谁都可以捏上一下。
但朱由检经过认真的考虑，还是决定立刻放弃铁山。道理也很简单，现在已经查清，皮岛的实力根本不像毛文龙吹嘘的那样强大，即使加上没在册、半兵半匪的万把人，也没到两万兵力。之所以毛文龙能成为后金的眼中钉、肉中刺，不是因为他占据了铁山，而是因为他拥有皮岛，而女真人没有海船，只能望洋兴叹。
可现在情况不一样了，首先朝鲜已经投降后金，暂时成了大明的敌国。那么滞留在铁山的两千多士卒，无疑就成为朝鲜的一个很好的攻击目标。就算朝鲜军队战斗力低下，也没必要在这个地方无谓地消耗宝贵的兵力。
再者，朝鲜可是有一支水师的，几十年前还出过一个李舜臣，与明军联手在露梁海大败日本海军。虽然现在也衰落得不像样子，毕竟有海战能力。再加上叛逃的孔有德、尚可喜和耿仲明，如果他们都被后金组织起来向东江镇发起进攻，铁山和皮岛必然首尾不能相顾，还不如收缩防守，巩固最重要的皮岛的防御。至于铁山，已经暂时失去了原来的战略地位，不要也罢。
于是，朱由检立即下达了从铁山撤军的圣旨。但是他不可能自己跑到铁山去指挥撤退，还是要依靠下面的将领。这就涉及到另外一个问题，就是东江镇军事领导层的重建。